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近來肉毒桿菌中毒事件都與真空包食品有關。衛生署公告，高風險真空包裝即食食品，要辦理查驗登記，如未經脫水、鹼化或商業滅菌等處理過程，必須全程冷藏，新措施11月14日實施。

根據衛生署公告的「真空包裝食品良好衛生規範」，真空包裝即食食品要符合水活性小於等於0.85、酸鹼值 (pH值)大於等於9.0、商業滅菌等3個條件中的任1項，才能常溫貯存及販售。

由於接連肉毒桿菌中毒病例，都有食用真空包裝即食食品，衛生署認為，豆製品、滷味肉類富含蛋白質，若未經滅菌處理或低溫抑菌，在真空缺氧狀況下，易使肉毒桿菌萌孢產毒；因此，這類高風險真空包裝即食食品，應辦理查驗登記。

如果真空包裝食品水活性大於0.85，衛生署則規定貯存、運輸及販售全程低於攝氏7度。假如是不含亞硝酸鹽或硝酸鹽、脫水 (水活性小於等於0.94)、偏酸(pH值小於等於4.6)、含鹽量超過3.5%的食品，例如肉乾、燻肉等，冷藏保存期限應在10天以內。

另外，冷凍貯存及販售的真空包裝即食食品規範，冷凍真空包裝即食食品的貯存、運輸及販售過程皆需於攝氏零下18度冷凍狀態下進行。

據衛生署食品藥物管理局了解，至少有3家真空包裝食品業者符合商業滅菌，其中1家在桃園大溪，大溪豆干業者在肉毒桿菌事件衝擊下，紛紛改賣現煮豆干、乾燥的調味豆干，少數販售真空包裝豆干者，都在包裝袋上，以長寬1公分字句註明必須冷藏及保存期限。